Presentations

招待講演（Invited talks）

安岡有理「発生ゲノミクスで探る脊椎動物の進化過程」『生命誌研究者セミナー』JT生命誌研究館　大阪府高槻市（2023年1月20日）
安岡有理「動物胚初期発生における遺伝子制御ネットワークとその進化に関する研究」『日本動物学会第93回早稲田大会』２０２２年度日本動物学会奨励賞受賞者講演　東京都新宿区（2022年9月９日）
Yuuri Yasuoka “Comparing fluctuation of gene expression profiles in embryos to dissect diversification of Xenopus tropicalis strains”『18th International Xenopus Conference』ポーツマス・オンライン開催（2021年8月18日）
安岡有理「Repeated subfunctionalization of Brachyury genes for notochord development（脊索の発生におけるBrachyury遺伝子の機能分担）」『日本進化学会第22回オンライン大会』S08 残りやすい遺伝子と残りにくい遺伝子～2020　オンライン開催（2020年9月8日）
安岡有理, 松本征仁, 八木研, 岡﨑康司「初期化因子GLIS1の進化的起源と祖先的役割」『日本動物学会第９１回大会』S2：テクノロジーが切り開く「シン・再生研究」　オンライン開催（2020年9月4日）
安岡有理「Xenopus胚でCRISPRi (dCas9)は有効か？」『第３回次世代両生類研究会』（Session1）愛知県岡崎市（2017年8月24日）
安岡有理「Xenopusにおける二つのBrachyury遺伝子の機能分化」『第１回次世代両生類研究会』（Session1: Functional genomics）愛知県岡崎市（2015年8月24日）
安岡有理、鈴木穣、高橋秀治、染谷春香、須藤則広、原本悦和、浅島誠、菅野純夫、平良眞規「両生類原腸胚の頭部オーガナイザーの転写基盤：頭部オーガナイザー転写因子Otx2、Lim1、GscのChIP-seq 解析」『第８５回日本動物学会』ナショナルバイオリソースプロジェクト（NBRP）シンポジウム「ネッタイツメガエル」—ツメガエルを用いた機能ゲノム科学研究　宮城県仙台市（2014年9月12日）
安岡有理「Otx2はXenopus原腸胚頭部オーガナイザーにおける位置情報タグとしてグローバルな遺伝子制御を行う」『ボディプラン研究グループ主催セミナー』　兵庫県神戸市（2011年9月15日）

国際学会発表（Presentations in international meetings）

Yuuri Yasuoka and Yasushi Okazaki “Genomic, transcriptomic, and proteomic approaches toward understanding mitochondrial genome evolution in frogs”（英語による口頭発表、査読あり）19th International Xenopus Conference (アメリカ)、2023年8月21日
Yuuri Yasuoka “Genome-wide measurement for fluctuation of gene regulatory networks in Xenopus embryos”（英語による口頭発表）Xenopus Resources and Emerging Technologies Meeting（アメリカ）、2019年10月14日
Yuuri Yasuoka, Ryo Koyanagi, Yuki Yasuoka, Chuya Shinzato, Nori Satoh “The “mesodermal” gene brachyury regulates ecotoderm-endoderm demarcation in a diploblastic animal, the scleractinian coral Acropora digitifera”（英語による口頭発表）Academia Sinica – OIST Joint Meeting（台湾）、2015年12月15日
Yuuri Yasuoka “Genomics Study of the Spemann-Mangold Organizer: Occupancy of Tissue-Specific cis-Regulatory Modules by Otx2 and TLE/Groucho for Embryonic Head Specification.”（英語による口頭発表、査読あり）15th International Xenopus Conference（アメリカ）、2014年8月26日
Yuuri Yasuoka, Yutaka Suzuki, Shuji Takahashi, Norihiro Sudou, Yoshikazu Haramoto, Ken W. Cho, Makoto Asashima, Sumio Sugano, and Masanori Taira “Head specification mediated by Otx2 partner with Lim1 or Gsc and control expression of thousands of target genes in a massively parallel fashion.”（ポスター発表）14th Xenopus international conference（フランス）、2012年9月9～13日
Yuuri Yasuoka, Norihiro Sudou, Yutaka Suzuki, Shuji Takahashi, Yoshikazu Haramoto, Makoto Asashima, Sumio Sugano and Masanori Taira “Versatile functions of Lim1/Lhx1 and Otx2 in the gastrula organizer gene regulatory network revealed by ChIP-sequence analysis” （ポスター発表）13th International Xenopus Conference（カナダ）、2010年9月12日～16日

国内学会発表（Presentations in domestic meetings）

安岡有理、岡﨑康司「シロアゴガエルATP8遺伝子は超保存モチーフを失ってもミトコンドリア呼吸鎖複合体Vで機能している」（口頭発表）日本動物学会第94回大会（山形）2023年9月9日
安岡有理、岡﨑康司「Genomic, transcriptomic, and proteomic approaches toward understanding mitochondrial genome evolution in the common tree frog, Polypedates leucomystax」（口頭発表）日本進化学会第25回大会（沖縄）2023年9月1日
安岡有理「ゲノム・トランスクリプトーム・プロテオームから見たシロアゴガエルミトコンドリアゲノム進化の背景」（口頭発表）広島大学両生類研究センターバイオリソース棟落成記念シンポジウム（東広島）2023年3月15日
安岡有理、岡﨑康司「ツメガエルを用いたミトコンドリアゲノム編集への挑戦ー第２章」（口頭発表）日本動物学会第93回大会（東京）2022年9月8日
安岡有理「初期胚における遺伝子発現の揺らぎと進化の関係を探る」（口頭発表）第24回日本進化学会年会（沼津）2022年8月6日
Yuuri Yasuoka, Chikara Furusawa, Yasushi Okazaki “Fluctuation of gene expression levels in early embryos is correlated to environmental and evolutionary responses（初期胚における遺伝子発現の揺らぎは環境応答および進化応答と相関する）”（英語による口頭発表、査読あり；およびポスター発表）第55回日本発生生物学会年会（金沢）2022年6月2日
安岡有理、古澤力、岡﨑康司「遺伝子発現の多様性から制御ネットワーク進化の制約と方向性を探る」JST CREST バイオDX領域キックオフシンポジウム（オンライン）、2021年11月21-22日
安岡有理、岡﨑康司「ツメガエルを用いたミトコンドリアゲノム編集への挑戦～序章～」（ポスター発表）日本動物学会第94回大会（米子、オンライン）、2021年9月2-4日
安岡有理「脊索の祖先的構成要素と形態形成様式の進化Ancestral components of the notochord and evolution of morphogenetic patterns」（ポスター発表）第23回日本進化学会年会（東京、オンライン）2021年8月18-21日
安岡有理「シロアゴガエルと疑似ロングリードシークエンス」（口頭発表）第14回日本ツメガエル研究集会、2021年6月19日
Yuuri Yasuoka, Masahito Matsumoto, Ken Yagi, and Yasushi Okazaki “Evolutionary History of GLIS1 and GLIS3 Illuminates Their Roles in Cell Reprograming and Ciliogenesis” （英語による口頭発表、査読あり）第54回日本発生生物学会年会（札幌、オンライン）、2021年6月18日
Yuuri Yasuoka “Genome-wide Measurement for Fluctuation of Gene Regulatory Networks in Xenopus embryos” （英語による口頭発表、シンポジウム主催）JSDB Online Trial Meeting 2020 2020年9月25日
安岡有理「ツメガエル胚発生におけるGRNの揺らぎ」（口頭発表）第13回日本ツメガエル研究集会（京都）、2019年9月10日
安岡有理、松本征仁、八木研、岡﨑康司 “Evolutionary History of GLIS Genes Illustrates their Fundamental Roles in Cell Reprogramming and Ciliogenesis（進化的起源から探る細胞初期化および繊毛形成におけるGLIS遺伝子の役割”（英語による口頭発表、査読あり）第21回日本進化学会年会（札幌）、2019年8月8日
Yuuri Yasuoka and Noriyuki Satoh “Why was the notail gene lost in many vertebrate lineages?（何故notail遺伝子は繰り返し失われたのか？）”（英語による口頭発表、査読あり）第52回日本発生生物学会年会（大阪）、2019年5月15日
Yuuri Yasuoka and Noriyuki Satoh “Complex evolution of brachyury paralogs during vertebrate notochord development” （ポスター発表、査読あり）第46回内藤コンファレンス（札幌）、2018年10月2-5日
安岡有理、佐藤矩行「脊椎動物の脊索発生におけるBrachyuryパラログの複雑な進化」（口頭発表）、第20回日本進化学会年会（東京）、2018年8月22日
安岡有理「進化学の視点がリプログラミング研究にどう貢献できるか？」（ショートトーク）第10回EvoDevo青年の会（東京）、2018年8月20日
安岡有理「ネッタイツメガエル胚発生における転写因子ー標的遺伝子関係の揺らぎ測定」（口頭発表）第12回XCIJ首都圏支部会（東京）、2018年7月14日
Yuuri Yasuoka “Keratan sulfate produces “water bags” in embryos” （英語による口頭発表、査読あり；およびポスター発表）第51回日本発生生物学会年会（東京）、2018年6月7-8日
Yuuri Yasuoka and Noriyuki Satoh “Independent subfunctionalization of brachyury paralogs in vertebrate lineages（脊椎動物各系統におけるbrachyuryパラログの独立した機能分化）”（ポスター発表）ConBio2017（神戸）、2017年12月7日
Yuuri Yasuoka and Noriyuki Satoh “Independent subfunctionalization of brachyury paralogs in vertebrate lineages”（ポスター発表）The 29^th CDB meeting（神戸）、2017年10月19-20日
安岡有理「細胞運動非依存的な脊索の自律的形態形成メカニズムを探る」（口頭発表）第10回日本ツメガエル研究集会（宮崎）、2017年9月8日
安岡有理「年に一度のサンゴ胚を用いた遺伝子機能解析」（口頭発表、査読あり）第3回ユニークな少数派実験動物を扱う若手が最先端アプローチを勉強する会（岡崎）、2017年8月25日
Yuuri Yasuoka and Noriyuki Satoh “Independent subfunctionalization of brachyury paralogs in vertebrate lineages（脊椎動物各系統におけるbrachyuryパラログの独立した機能分化）”（英語による口頭発表、査読あり；およびポスター発表）第50回日本発生生物学会年会（東京）、2017年5月10-12日
安岡有理「脊椎動物にけるBrachyuryの遺伝子重複がもつ進化的意義」（口頭発表）第10回日本ツメガエル研究集会（沖縄）、2016年11月19日
Yuuri Yasuoka, Chuya Shinzato, and Noriyuki Satoh “The mesoderm-forming gene, brachyury, regulates ectoderm-endoderm demarcation in a diploblast, the coral, Acropora digitifera”（ポスター発表）第22回国際動物学会議・第87回日本動物学会合同大会（沖縄）、2016年11月17-18日
安岡有理、小柳亮、安岡由貴、新里宙也、佐藤矩行「脊椎動物胚における中胚葉遺伝子Brachyuryは二胚葉動物ミドリイシサンゴの胚発生において外胚葉と内胚葉の分離に働く」（口頭発表、査読あり）日本進化学会第17回大会（東京）、2015年8月21日
Yuuri Yasuoka, Ryo Koyanagi, and Noriyuki Satoh “Subfunctionalization of two brachyury genes in Xenopus reveals Brachyury functions in the vertebrate notochord”（英語による口頭発表、査読あり）第48回日本発生生物学会年会（つくば）、2015年6月3日
Yuuri Yasuoka, Ryo Koyanagi, Chuya Shinzato and Noriyuki Satoh “Functional analysis of the T-box transcription factor Brachyury in coral gastrula embryos.”（英語による口頭発表、査読あり）第47回日本発生生物学会年会（名古屋）、2014年5月28日
Yuuri Yasuoka “Enhancer Chromatin Signatures during Gastrulation of Xenopus Embryos”（ポスター発表）CDB Symposium 2013 “The Making of a Vertebrate”（神戸）、2013年3月6-8日
安岡有理 ”NGS analyses using Xenopus embryos (Xenopus胚を用いた次世代シーケンス解析)”（口頭発表）第6回 XCIJ首都圏支部会(XCIJ-MA)　兼　第6回日本ツメガエル研究集会（東京）2012年7月14日
Yuuri Yasuoka, Yutaka Suzuki, Shuji Takahashi, Norihiro Sudou, Yoshikazu Haramoto, Yukiko Tandou, Kaoru Kubokawa, Ken W. Cho, Makoto Asashima, Sumio Sugano, Masanori Taira “Massively parallel regulation of head and non-head genes by Otx2, Lim1 and Gsc underlies the evolution of the head organizer in the chordate”（英語での口頭発表、査読あり；およびポスター発表）第45回日本発生生物学会・第64回日本細胞生物学会合同大会（神戸）2012年5月28-31日
安岡有理 “Massively parallel regulation of head and non-head genes by Otx2, Lim1 and Gsc in early vertebrate embryos”（口頭発表）転写代謝システム・転写研究会共催「若手ワークショップ＠湯河原」（静岡）、2012年2月10日
Yuuri Yasuoka, Norihiro Sudou, Shuji Takahashi, Yukiko Tando, Yutaka Suzuki, Sumio Sugano, Kaoru, Kubokawa, Makoto Asashima and Masanori Taira “The molecular entity of positional information revealed by ChIP-sequence analysis for Lim1 and Otx2 in the head organizer and its application for evolutionary analysis(頭部オーガナイザーにおけるLim1とOtx2のChIP-sequence解析から明らかになった位置情報の分子実体とその進化解析への応用)” （英語での口頭発表、査読あり；およびポスター発表）第44回日本発生生物学会大会（沖縄）、2011年5月
Yuuri Yasuoka, Norihiro Sudou, Yutaka Suzuki, Shuji Takahashi, Yoshikazu Haramoto, Makoto Asashima, Sumio Sugano and Masanori Taira “ChIP-sequence analysis for Lim1 and Otx2 in the Spemann-Mangold organizer” （英語での口頭発表、査読あり）OIST Winter Course “Evolution of Complex Systems” (OWECS2010)（沖縄）、2010年12月6日
安岡有理、須藤則広、高橋秀治、鈴木穣、丹藤由希子、窪川かおる、菅野純夫、浅島誠、平良眞規「脊椎動物原腸胚オーガナイザーにおける転写制御ネットワークとその進化（The overview of transcriptional networks in the vertebrate gastrula organizer and its evolution）」（口頭発表）第81回日本動物学会大会（東京）、2010年9月23日
安岡有理, 丹藤由希子, 窪川かおる, 平良眞規「脊椎動物の頭部オーガナイザー獲得に関わるエンハンサー進化」（口頭発表、査読あり）第12回日本進化学会年大会（東京）、2010年8月3日
Yuuri Yasuoka, Norihiro Sudou, Shuji Takahashi, Yukiko Tando, Yutaka Suzuki, Sumio Sugano, Kaoru, Kubokawa, Makoto Asashima and Masanori Taira “Evolutionary comparison of Lhx1 and Otx2 transcriptional regulatory networks in the gastrula organizer using chromatin immunoprecipitation (ChIP) analysis（原腸胚オーガナイザーにおけるLhx1とOtx2の転写制御ネットワークのChIP解析を用いた進化的比較）” （ポスター発表）第43回日本発生生物学会大会（京都）2010年6月20-23日
安岡有理 「ツメガエルとイソギンチャクを用いた原腸胚オーガナイザーのEvo-Devo解析」（日本語での口頭発表）第3回XCIJ-MA研究集会（東京）、2009年11月21日
Yuuri Yasuoka, Yuuki Goya, Koji Akasaka, Hidetoshi Saiga and Masanori Taira “Evolutionarily conserved roles of the Lhx1/Ldb/Ssbp complex in the organizer from Nematostella to Xenopus （真正後生動物で進化的に保存されたLhx1/Ldb/Ssbp複合体のオーガナイザーにおける役割）” （英語での口頭発表、査読あり）第42回日本発生生物学会大会（新潟）、2009年5月29日
Yuuri Yasuoka “Evolutionary Roots of Blastoporal Expression and ‘Organizer’ Activity of the Vertebrate Gastrula Organizer Gene lhx1 and Its Ancient Paralog lhx3” （英語での口頭発表、査読有り；およびポスター発表）The 8th NIBB-EMBL Joint Meeting Evolution: Genomes, Cell Types and Shapes（岡崎）、2008年11月
Yuuri Yasuoka, Masaaki Kobayashi, Daisuke Kurokawa, Koji Akasaka, Hidetoshi Saiga, Masanori Taira “Protein evolution of the LIM-homeodomain transcription factors Lhx1 and Lhx3 in acquisition of the vertebrate gastrula organizer” （英語での口頭発表、査読有り）第41回日本発生生物学会大会（徳島）、2008年5月
安岡有理、小林正明、黒川大輔、赤坂甲治、西駕秀俊、平良眞規「LIMホメオドメインタンパク質Lim1とLim3のオーガナイザー活性における機能比較を通じた進化生物学的解析」（口頭発表、査読有り；およびポスター発表）第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会　合同大会（横浜）2007年12月